Морато, уроженец Франсиску Морату, Бразилия, начал свою карьеру в молодежном составе Сан-Паулу. В сентябре 2019 года он перешел в Бенфику за 6 миллионов евро, причем бразильский клуб сохранил 15% прав на его следующий трансфер. Дебют Морато в профессиональном футболе состоялся 22 сентября 2019 года в матче Бенфики Б против Лейшойнш. В декабре того же года он дебютировал в основном составе команды в матче Кубка лиги против Витории Сетубал. В сезоне 2020–2021 Морато впервые вышел на поле в Примейре Лиге и сыграл в финале Кубка Португалии. В сезоне 2021–2022 он закрепился в основном составе благодаря травме ветерана Яна Вертонгена и забил свой первый гол в Лиге чемпионов. Морато также получил звание лучшего защитника месяца в августе 2022 года. В ноябре 2019 года он был вызван в сборную Бразилии до 20 лет.